Le Cycle ingénieur de l’Institut National Agronomique de Tunisie débute par une 1^ère année de tronc commun suivie de deux années de Formation (2^ème année et 3^ème année) dans une des sept spécialités de Sciences Agronomiques assurées par l’Institut :

- Sciences de la Production végétale

- Production Animale

-Génie Rural, Eaux et Forêts

- Génie Halieutique et Environnement

- Industries Agroalimentaires

- Phytiatrie

- Economie et Gestion Agricole et Agroalimentaire

L’année universitaire est composée de 2 semestres et chaque semestre est composé de deux séquences d’enseignement :

o   1^er Semestre de septembre à janvier :

• 1^ère Séquence de septembre à novembre :
• 2^ème Séquence de novembre à janvier :

o   2^ème semestre de janvier à juin.

• 3^ème Séquence de janvier à mars :
• 4^ème Séquence d’avril à juin :

L’Institut National Agronomique de Tunisie est habilité à délivrer les diplômes de :

Masters de recherche :

• Master en Bioagresseurs et Santé Végétale (M2)
• Master en Gestion Durable des Ressources En Eau (M2)
• Master en Valorisation et Innovation des Ressources Alimentaires Agroalimentaires, Santé et Naturalité (M2) 
• Master en Fonctionnement et Gestion des Ecosystèmes Aquatiques (M2) 
• Master en Biotechnologie Animale (M2) 
• Master en Gestion des Ecosystèmes Naturels et Valorisations de leurs Ressources (M2) 
• Master en Aridoculture et Lutte Contre la Désertification (M2)
• Master en Valorisation Biotechnologique des Ressources Marines (M2)

Masters professionnels:

• Master en Techniques avicoles et industrie d’aliments composés (M1 et M2)
• Master en Irrigation et Drainage (M2).